El Centro, tiene  su origen noviembre del año 1991, al alero del Departamento de Ciencias Sociales de la Universidad de Los Lagos, entonces Instituto Profesional de Osorno, con la denominación Centro  “LIDER”,   Labor Interdisciplinaria de Desarrollo Regional. Ésta denominación,  se traspasó a  la publicación del Centro, creada un año más tarde, y que permanece hasta hoy día, la Revista LIDER.

En el año 2000 el CEDER reafirma y consolida su quehacer académico mediante un proyecto Mecesup, el que le permitió crear el primer programa de postgrado en la institución, el cual se expreso en la implementación del Magíster en Ciencias Sociales, Mención Estudios de Procesos y Desarrollo de las Sociedades Regionales, el cual formó a profesionales de diversas disciplinas de organismos regionales y estudiantes extranjeros, la implementación de una moderna biblioteca, un laboratorio de cartografía y un laboratorio de computación; en la actualidad además del Magíster en Ciencias Sociales se imparte el Magíster en Gestión Publica y Desarrollo Regional y Local.

A partir de entonces, incrementa su actividad en proyectos de investigación que realiza en conjunto con centros internacionales, generando convenios de colaboración y pasantías de estudiantes y docentes de diversos institutos, universidades y centros de investigación.

A nivel local e inclusive en el ámbito nacional,  participa activamente a través de consultorías y asesorías.